1-Bit Ninja è un platform 2D con una grafica assolutamente minimale, i personaggi sono disegnati con una manciata di pixel e gli sfondi sono praticamente privi di dettaglio. Ad una prima occhiata il gioco ricorda i vecchi giochi per Game Boy come Super Mario Land, ed il paragone non è poi così azzardo.
Il gioco si distingue dalla massa non solo per lo stile grafico, ma anche per la possibilità di cambiare la prospettiva del piano di gioco, come succede ad esempio in Paper Mario per Wii, con un tocco possiamo spostare la prospettiva da 2D a 3D.